脂質組學研究的工具和技術 | 油脂營養成分查詢網
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2022年6月30日—靶向脂質分析可能需要樣品製備,包括富集、消耗或加標(帶或不帶標記)。“與所有'組學一樣,濃度動態範圍是脂質組學的一個問題,特別是在有針對性的實驗 ...
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脂質同時是最簡單和最複雜的感興趣的生物分子。雖然蛋白質是由來自 5 個核苷酸的 21 個氨基酸和基因的組合構成的,但脂質中的主要重複單位是 -CH x -。當包括分支和不飽和(可能有順式和反式幾何形狀)時,存在幾乎無限數量的變化。有人可能會爭辯說代謝物在化學上更加多樣化,但這僅僅是因為它們完全來自其他分子類別。
不僅僅是“脂肪”說“脂質”,有機化學家會想到脂肪、油或蠟,但脂質組比碳氫化合物主題的相關變化要多樣化得多。脂質組學公共資源LIPID MAPS ®結構數據庫 ( LMSD ) 包含 47,449 個獨特的脂質結構,使其成為世界上最大的脂質組學數據庫。[1]截至 2022 年 4 月 1 日,LMSD 包含 47,449 種獨特的脂質結構,屬於八個分子類別:脂肪酸、甘油脂、甘油磷脂、鞘脂、甾醇脂、異戊烯醇脂、醣脂和聚酮化合物。
鍊長、位置異構化和功能化是脂質類別中三個明顯的結構特徵和化學分化點。幸運的是,它們也是用現代分析方法很容易區分的特徵。
由於脂質組學和代謝組學重疊,前者有時被稱為後者的子集。雖然重疊很重要,但由於實際原因,代謝物僅限於分子量低於 1500 Da 左右的代謝產物。“脂質都是疏水的,儘管有些類別可以通過水萃取分離出來,”在 Thermo Fisher Scientific 從事代謝組學應用開發的 Rahul Deshpande 博士說。“由於脂質以獨特的方式發揮作用,並且它們的分析涉及一組有限的技術,它們屬於自己的‘組學類別’。但請記住,存在一些灰色區域。”
另一個微妙的點將脂質與其他“組學”區分開來。來自植物或動物樣品的細胞部分,在對其化學成分進行裂解和分餾時,含有宿主生物代謝(分解代謝和合成代謝)產生的蛋白質組、基因組和代謝組產品。然而,脂質部分可能來自所研究生物體中的類似過程,或者是從飲食中獲得的。“它們是代謝物,但來自與正在研究的生物不同的生物體,”Deshpande 解釋說。
經典的脂質分析涉及水解脂質...
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